A mi me pasó eso, es mas, si le sacás una captura al pegarla en Paint, la imagen no se ve ensanchada. Pero en el monitor sí, lo que podés hacer (algo que yo hice) es ajustar manualmente el ancho del monitor, lo vas achicando de los costados hasta que queda como querés. Con los bordes negros como mencionaste.
Si no, otra opción es jugarlo en ventana, y no en pantalla completa.
Eso pasa con los TR 4 y 5 (con el 3 no me pasó, porque me dejaba poner resolucion panoramica)
En cuanto a los niveles del autor, ultimamente veo que son cada vez mas los niveles que vienen con la opcion Pantalla Panoramica para poder poner resoluciones tales que no se vea la pantalla ensanchada. En formato 16:9 o 16:10. Y así, ellos mismos te solucionan el problema, podes jugar en pantalla completa y con la imagen sin ensanchar.